以下是一些免費(fèi)的密碼子優(yōu)化在線軟件：

1. CodonWizard：CodonWizard是一個(gè)在線工具，可以幫助您分析基因序列并預(yù)測(cè)最優(yōu)的密碼子。它提供了多種語(yǔ)言支持，并允許您將您的基因序列上傳到網(wǎng)站上進(jìn)行分析。

2. BLAST+：BLAST+是一個(gè)在線工具，可以用于搜索蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)以找到與您的序列相匹配的蛋白質(zhì)。您可以使用BLAST+來(lái)查找可能的密碼子優(yōu)化策略，并將其應(yīng)用于您的基因序列。

3. GeneTools：GeneTools是一個(gè)在線工具，可以用于分析基因序列和預(yù)測(cè)最優(yōu)的密碼子。它提供了多種功能，包括比對(duì)、編輯距離計(jì)算和密碼子優(yōu)化策略建議。

4. Bioinformatics Toolkit：Bioinformatics Toolkit是一個(gè)開(kāi)源軟件包，包含了許多用于生物信息學(xué)的工具，其中就包括密碼子優(yōu)化工具。您可以下載并使用這些工具來(lái)幫助您分析和優(yōu)化基因序列。

這些工具可能需要付費(fèi)訂閱或購(gòu)買許可證才能使用全部功能。