在自由貿(mào)易試驗區(qū)出現(xiàn)以前，貨物入境就需要繳納關(guān)稅，這給進出口企業(yè)帶來了資金壓力。

保稅區(qū)出現(xiàn)后，貨物停留在保稅區(qū)內(nèi)無須繳稅，可以對貨物進行存儲、加工、改裝、混合、分類、展覽等；貨物離開保稅區(qū)人境則需要繳稅；貨離開保稅區(qū)出境則不需要繳稅。

自由貿(mào)易試驗區(qū)的優(yōu)惠政策更多，可簡要歸納為“五個自由”：(一)貿(mào)易自由推動跨境貨物貿(mào)易、服務(wù)貿(mào)易和新型國際貿(mào)易結(jié)算便利化，促進跨境貿(mào)易各要素自由便捷流動，逐步推進區(qū)域性新型國際貿(mào)易中心建設(shè)。

貨物貿(mào)易領(lǐng)域：實施“零關(guān)稅”，有效配置國際國內(nèi)兩種資源；服務(wù)貿(mào)易領(lǐng)域：“既準入又準營”，破除服務(wù)貿(mào)易壁壘。

實施進出口商品管制負面清單管理；高標準建設(shè)國際貿(mào)易“單一窗口”；建立“一線”放開、“二線”管住口岸監(jiān)管新模式；推動各類貿(mào)易融合發(fā)展，建設(shè)區(qū)域性離岸新型國際貿(mào)易中心。

(二)人員進出自由建立與國際接軌、有中國特色的人才服務(wù)管理機制，建立市場導向的人才引進和認定機制，建立外國人來華工作許可負面清單管理制度及工作居留許可一體化管理模式等。

(三)資金流通自由實質(zhì)上是金融開放，如人民幣資本項目放開、實施離岸金融中心政策等，使跨境資金流動更自由便利。

(四)貨物存儲自由在自由貿(mào)易試驗區(qū)內(nèi)，貨物存儲期限不受限制，和保稅區(qū)僅能在固定期限內(nèi)存儲相比更具優(yōu)勢。

(五)貨物進出自由在自由貿(mào)易試驗區(qū)，貨物流通暢通，多數(shù)自由貿(mào)易試驗區(qū)采取門崗管理方式，運作手續(xù)簡化，比保稅區(qū)的“賬冊管理”更為簡化，交易成本更低。