關(guān)務(wù)風險并不僅僅來自申報階段的操作失誤、不夠熟練和疏忽遺漏，還來自企業(yè)管理制度的不完善和管理層的動機。

(一)管理層或者委托方的非法經(jīng)營動機對企業(yè)來說，管理層就是企業(yè)“龍頭”，其價值導向和經(jīng)營理念直接會導致一個企業(yè)是“正道”經(jīng)營、“邪道”經(jīng)營，還是走“偏鋒”。

管理層的經(jīng)營理念直接決定其對關(guān)務(wù)風險的態(tài)度和重視程度。

如果管理層不是在技術(shù)創(chuàng)新、生產(chǎn)經(jīng)營和管理創(chuàng)新上下功夫，而在關(guān)務(wù)方面過分強調(diào)降低成本，把降低關(guān)務(wù)成本作為競爭優(yōu)勢和利潤源泉，那么管理層可能會要求報關(guān)人員盡量采取“低稅率的商品歸類”、瞞報價格，甚至是直接走私或偷漏稅。

長此以往，整個企業(yè)就是一個徹頭徹尾的走私集團，陷人其中的經(jīng)辦人員也將會被要求參與到非法活動中，對其個人而言，也將面臨巨大的法律風險。

對報關(guān)人員和關(guān)務(wù)管理人員來說，選擇一個合法經(jīng)營、理解關(guān)務(wù)的管理層，是減少自身風險的關(guān)鍵。

對受托代理報關(guān)的第三方報關(guān)企業(yè)來說，選擇守法經(jīng)營的委托方，是減少自己法律風險的關(guān)鍵。

(二)關(guān)務(wù)人員素質(zhì)不高、舞弊或管理不當關(guān)務(wù)人員在關(guān)務(wù)管理中是一個關(guān)鍵的職位，因為關(guān)務(wù)人員向海關(guān)所作的申報直接代表著企業(yè)的申報。

雖然海關(guān)一方面利用報關(guān)人員培訓、管理等制度來加強對報關(guān)人員的管理和提升其素質(zhì)，另一方面要求管理層甚至法人在提交海關(guān)的資料上簽字，從制度上要求企業(yè)管理層介入關(guān)務(wù)日常管理，但是，由于關(guān)務(wù)的復雜性和特殊性，很少有管理層能夠真正理解申報的內(nèi)容和影響。

(三)關(guān)務(wù)管理的內(nèi)部控制薄弱(四)商業(yè)和交易模式與關(guān)務(wù)管理資源不匹配良好的關(guān)務(wù)規(guī)劃和關(guān)務(wù)管理模式有助于節(jié)省企業(yè)的經(jīng)營成本和稅負，便利企業(yè)的物流和通關(guān)。

相反，不適當?shù)年P(guān)務(wù)規(guī)劃和關(guān)務(wù)管理模式可能會使企業(yè)因小失大，甚至不能有效運作。

(五)關(guān)務(wù)管理模式和系統(tǒng)不相匹配就關(guān)務(wù)管理來說，功能強大、數(shù)據(jù)自動獲取、申報數(shù)據(jù)自動生成的關(guān)務(wù)管理系統(tǒng)越來越成為必需的工具。

一般來說，系統(tǒng)自動生成可以減少人工輸入、計算的錯誤和疏忽。

但是，計算機系統(tǒng)一旦出錯，可能會導致連續(xù)的、多發(fā)的、常規(guī)的申報錯誤。

關(guān)務(wù)管理模式因企業(yè)的不同而不同，別的企業(yè)運作很成功的模式，可能并不適合自己的企業(yè)；別的國家很適用的管理模式和計算機系統(tǒng)，可能在中國不適用甚至無法運作；在過去很得心應手的方式現(xiàn)在可能不再適用。

(六)境外商業(yè)伙伴舞弊或者信息錯誤作為進口商，從供應商準確獲得到貨的時間和地點有利于關(guān)務(wù)申報的提前準備和安排。

對進口貨物而言，向海關(guān)申報的數(shù)據(jù)大部分來自供應商，例如，商品的名稱(屬性)、價格、原產(chǎn)地、數(shù)量和重量等。

這些信息在到貨以前，作為報人的進口方，可能知道得不多，基本上是完全依賴供貨商的信息。

如果供貨商提供的信息與實際有差異,將會直接導致不能申報或者申報錯誤。