政策不明確：跨境電商出口退稅的政策規(guī)定較為復(fù)雜，不同國家和地區(qū)的稅收政策差異較大，導(dǎo)致企業(yè)在實際操作中難以把握。

申報流程繁瑣：跨境電商出口退稅的申報流程較為繁瑣，需要企業(yè)提交大量的材料和證明，且審核周期較長，容易導(dǎo)致企業(yè)錯過退稅時機。

資金壓力大：跨境電商出口退稅的資金壓力較大，企業(yè)需要承擔(dān)較高的退稅成本，且退稅金額往往低于實際銷售額，導(dǎo)致企業(yè)利潤受損。

信息不對稱：跨境電商出口企業(yè)在退稅過程中面臨信息不對稱的問題，如對稅收政策、退稅流程等了解不足，容易導(dǎo)致企業(yè)陷入困境。

技術(shù)難題：跨境電商出口企業(yè)在進(jìn)行退稅申報時，需要使用到復(fù)雜的技術(shù)手段，如電子發(fā)票、電子申報等，但部分企業(yè)可能缺乏相應(yīng)的技術(shù)支持，導(dǎo)致退稅申報失敗。

法律法規(guī)滯后：跨境電商出口退稅的法律法規(guī)制定相對滯后，難以適應(yīng)快速發(fā)展的電商行業(yè)，導(dǎo)致企業(yè)在實際操作中遇到法律問題。

跨境物流成本高：跨境電商出口企業(yè)在進(jìn)行退稅申報時，需要提供大量的物流單據(jù)，如運輸發(fā)票、報關(guān)單等，這些單據(jù)的獲取和整理成本較高，增加了企業(yè)的負(fù)擔(dān)。

信用風(fēng)險：跨境電商出口企業(yè)在進(jìn)行退稅申報時，需要提供真實的交易憑證和發(fā)票，一旦出現(xiàn)虛假申報或逃稅行為，將對企業(yè)聲譽和信用造成嚴(yán)重影響。

匯率波動風(fēng)險：跨境電商出口企業(yè)在進(jìn)行退稅申報時，需要考慮匯率波動對退稅金額的影響，但匯率波動較大，容易導(dǎo)致企業(yè)退稅金額不穩(wěn)定。

競爭激烈：跨境電商市場競爭激烈，企業(yè)為了降低成本、提高競爭力，可能會采取一些違規(guī)操作，如虛開增值稅發(fā)票、逃避稅收等，給退稅工作帶來難度。