通關(guān)效率低下：由于各國(guó)的貿(mào)易政策、關(guān)稅制度、法律法規(guī)等不同，導(dǎo)致跨境口岸的通關(guān)效率較低。貨物在通關(guān)過(guò)程中需要經(jīng)過(guò)多個(gè)環(huán)節(jié)，如申報(bào)、查驗(yàn)、放行等，耗時(shí)較長(zhǎng)，影響整體的物流效率。

信息不對(duì)稱：跨境口岸的信息共享機(jī)制不完善，導(dǎo)致信息不對(duì)稱，企業(yè)無(wú)法及時(shí)獲取到最新的政策、法規(guī)等信息，影響企業(yè)的決策。

基礎(chǔ)設(shè)施落后：部分跨境口岸的基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)相對(duì)落后，如交通設(shè)施、通信設(shè)施等，影響貨物的運(yùn)輸和信息的傳遞。

人力資源短缺：由于跨境口岸涉及的國(guó)家較多，涉及的語(yǔ)言、文化、法律等方面的差異較大，導(dǎo)致人力資源短缺，難以滿足日益增長(zhǎng)的通關(guān)需求。

安全風(fēng)險(xiǎn)：跨境口岸涉及到多個(gè)國(guó)家，存在較大的安全風(fēng)險(xiǎn)。例如，走私、偷稅漏稅、恐怖主義等行為可能對(duì)口岸的安全構(gòu)成威脅。

環(huán)境保護(hù)問(wèn)題：跨境口岸的建設(shè)和運(yùn)營(yíng)可能會(huì)對(duì)周邊環(huán)境造成一定的影響，如污染、噪音等問(wèn)題。

服務(wù)質(zhì)量參差不齊：由于跨境口岸涉及的國(guó)家較多，涉及的語(yǔ)言、文化、法律等方面的差異較大，導(dǎo)致服務(wù)質(zhì)量參差不齊，影響企業(yè)的滿意度。

法規(guī)執(zhí)行力度不一：不同國(guó)家對(duì)于跨境口岸的法規(guī)執(zhí)行力度不一，可能導(dǎo)致企業(yè)在通關(guān)過(guò)程中面臨不公平的競(jìng)爭(zhēng)環(huán)境。